Il Congresso è l’organismo massimo deliberante della Unione Sindacale Territoriale. Esso si riunisce in via ordinaria in corrispondenza con la convocazione del Congresso confederale o immediatamente prima di questo, salvo le convocazioni straordinarie. E’ composto dai delegati eletti dai congressi delle rispettive organizzazioni territoriali di categoria.
Il Congresso dell’Unione fissa le direttive generali dell’attività dell’Unione in armonia con gli indirizzi Confederali; in particolare si pronuncia sulla relazione morale e finanziaria della Segreteria ed elegge i componenti elettivi del Consiglio Generale.

Il Congresso